预付款保函和预收款退款保函的区别：预付款保函时施工方开给业主的，业务见函付预付款，施工方则要按照施工合同施工，若施工方违约，开函行将会将保函金额对应金额赔付给业务。预收款退款保函顾名思义方向相反，是业务开给施工方的，目前这种用到的比较少。
选择保函的开具银行。 经办人要按标书或合同中规定的要求在招标人（业主）可接受的当地银行或者选择在我国的银行抑或其他国际性银行开具保函。选择保函的开具银行时，要符合标书或合同中规定的银行信誉、支付方式的要求；如果合同中规定业主可用两种货币向承包人结算。那么，在选择担保行时，承包人应注意所选的担保行是否可用二种相应的货币开具保函。另外，经办人还应与所选定的担保行商定保函手续费的取费标准、付款方式、保函所需押金（付款准备金）的存入、抵押形式及数量、币种。
在保函有效期内，经办人要密切与担保银行的联系，随时向担保银行提供足以证明合同义务履行的文件、资料，要求逐步减少担保金额或注销担保金额。 如有的合同是一次性履行合同义务，当一次性的合同义务履行完毕后，经办人应尽快将有关文件送给担保银行，并声明拒绝招标人的任何索赔，必要时还可要求担保银行通知招标人或业主。如有的合同是多次履行合同义务的，则每履行完其中一项义务后，经办人就应当向银行提供一次文件（提单、发票、完工证书、验收证明等），并要求递减担保金额，以拒绝招标人对这一项义务的索赔。企业的业务部门和财务部门应密切配合共同完成这项工作，以防止或减少对外经济合同中产生的不必要纠纷和不应当承担的赔偿。
履约保函是指：应劳务方和承包方（申请人）的请求，银行金融机构向工程的业主方（受益人）做出的一种履约保证承诺。如果劳务方和承包方日后未能按时、按质、按量完成其所承建的工程，则银行将向业主方支付一笔约占合约金额5%~10%的款项。履约保函有一定的格式限制，也有一定的条件。