商业保函，是由除银行以外的，实力雄厚的商业机构出具的保函，一般多为专业担保公司开具的公司保函，是商业机构信用担保。费用比银行办函便宜的多，有的可以低于50%以上。对与建筑企业来说，相对是比较节约成本的。
区别：银行保函是以银行信用为担保，承担人是银行。
而商业保函是除银行以外有信誉的，实力雄厚的商业机构出具的保函，以商业机构（担保公司）信用为担保，承担人是商业机构（担保公司）。
银行保函： 1. 银行保函又称保证书，是指银行、保险公司、担保公司或担保人应申请人的请求，向受益人开立的一种书面信用担保凭证，保证在申请人未能按双方协议履行其责任或义务时，由担保人代其履行一定金额、一定时限范围内的某种支付或经济赔偿责任； 2. 现阶段常用的银行保函为：投标保函、履约保函、支付保函、预付款保函。 履约保函： 1. 履约保函 Performance Guarantee，指应劳务方和承包方（申请人）的请求，银行金融机构向工程的业主方（受益人）做出的一种履约保证承诺； 2. 如果劳务方和承包方日后未能按时、按质、按量完成其所承建的工程，则银行将向业主方支付一笔约占合约金额5%~10%的款项； 3. 履约保函有一定的格式限制，也有一定的条件。 商业保函： 商业保函是指除银行以外有信誉的，实力雄厚的商业机构出具的保函。
商业保函的制度保障和政策支持：
（1）2016年12月27日，为贯彻落实《办公厅关于清理规范工程建设领域保证金的通知》（国办发〔2016〕49号）精神，规范建设工程质量保证金管理，住房城乡建设部、财政部下发了《关于印发建设工程质量保证金管理办法的通知》（建质〔2016〕295 号），为工程质量保证金管理提供了制度保障； （来源 /xinwen/2017-01/03/content_5156076.htm）
（2）2017年2月12日，《办公厅关于促进建筑业持续健康发展的意见》，引导承包企业以银行保函或担保公司保函的形式，向建设单位提供履约担保。（来源 /zhengce/content/2017-02/24/content_5170625.htm ）
（3）2017年6月20日，为贯彻落实关于进一步清理规范涉企收费、切实减轻建筑业企业负担的精神，规范建设工程质量保证金管理，住房城乡建设部、财政部对《建设工程质量保证金管理办法》（建质〔2016〕295号）进行了修订，下发了《关于印发建设工 程质量保证金管理办法的通知》建质〔2017〕138号； （来源：/xinwen/2017-07/05/content_5208033.htm）
（4）2017年8月2日，《融资担保公司监督管理条例》，工程保证金大变革，保证金将退出历史舞台。（来源：/premier/2017-08/21/content_5219347.htm）
（5）2017年8月21日，国资委与住建部办公厅联合下发了《关于进一步推动中央企业工程建设领域保证金保函替代工作有关事项的通知》（国资厅发财管〔2017〕49 号）
（6）2017年9月26日，财政部工业和信息化部下发了《关于公布部门涉企保证金目录清单的通知》（工信部联运行〔2017〕236号）
（7）2018年4月4日。办公厅关于促进建筑业持续健康发展的意见，国办发〔2017〕19号，意见中第五大点第（九）条明确指出：加强承包履约管理。引导承包企业以银行保函或担保公司保函的形式，向建设单位提供履约担保。
履约保函相对于履约保证金的优点要从两个方面来看：
对承包方而言，减少由于缴纳现金保证金引起的长时间资金占用，获得资金收益，优化资金配置，且能更好地维护自身权益；
对业主方而言，能合理制约承包方行为，维护自身利益，也避免了收取、退回保证金程序的烦琐，提高工作效率。
履约保函的用途有哪些呢？
适用于任何工程中需对当事人履行合同义务提供担保的情况，常见于工程承包、转包等；
保函金额通常相当于合同总金额的5～10%。