保函的办理，特别是分离式保函，也就是通过担保公司办的。保函办理的流程是收集资料，先委托担保合同，银行过审，打款出保函。由于建筑行业存在很多挂靠项目，收集资料和签合同是办理银行保函难的地方，部分项目无法配合签字盖章，造成了银行保函无法成功办理。
保函担保属于信用担保，银行给企业提供信用担保，企业自身的信用比较关键，企业信报上如果有诉讼时，会要求提供相应的处理说明，如果是失信企业，则无法办理银行保函。因此，开始办理银行保函时，都会先查企业征信。
保函手续费包括以下内容：
1、支付保函手续费：银行为客户开立支付保函业务时，需要向客户征收每季千分之五的保函手续费季，是500元每季。
2、履约保函手续费：银行为客户开立履约保函业务时，需要像客户征收每季0.5%的保函手续费，指导度收取500元。
3、投标保函手续费：银行为客户开立投标保函业务时，需要像客户征收每季0.5%的保函手续费，指导度收取500元。
4、分期付款与延期付款保函手续费：银行为客户开立分期付款、延期付款保函业务时，均需要像客户征续费，指导价为0.15%，每季度收取500元。
5、关税保函手续费：银行为客户开立关税保函业务时，需要向客户征收每季0.5%的保函手续费，指导度收取500元。
1、基本流程
(1) 营业执照副本、法人代码证副本、税务登记证副本和法定代表人证明文件等;
(2) 对外担保主合同、协议或标书及有关交易背景资料;
(3) 担保涉及的事项按规定须事先获得有关部门批准或核准的，须提供有关部门的批 准或核准文件;
(4) 经会计(审计)师事务所审计的上两年财务报表及当期财务报表;
(5) 反担保措施证明文件;
(6) 银行要求的其它资料。
2、银行进行调查、审查
银行收到申请和有关资料后，对申请人的合法性、财务状况的真实性、交易背景的真实性等进行调查，了解借款人的履约、偿付能力，对申请人的进行授信评级，向申请人做出正式答复。
3、 审批同意
审批同意后，签订《保函协议书》或《贷款承诺协议书》，申请人存入相应比例的保证金，办理抵质押或反担保手续，银行出具保函或贷款承诺书。
银行同意开立保函后，与申请人签订“开立担保协议”，约定担保种类、用途、金额、费率、担保有效期，付款条件，双方的权利、义务，违约责任和双方认为需要约定的其它事项;对于需提供反担保的，还应按银行要求办理反担保手续。